Таємнича організація, рухома ідеєю очистити світ від наддержав, залишивши в живих тільки «чистих» людей без примхи, здійснила теракт, використовуючи бомбу, яка виводить наддержави з-під контролю. Цей інцидент став міжнародною загрозою. В ході розслідування було знайдено ще двадцять п'ять таких же жахливих бомб, розкиданих по всьому світу. Тому Ідзуку Мідорія і всі студенти Академії Юей разом зі своїми наставниками відправляються в різні куточки світу, щоб запобігти катастрофі, що означає кінець світу.