Ця історія розповідає історію чарівної дівчини Акко. Хоча, називати її чарівницею було б не зовсім коректно. Вона виросла в звичайній родині, тому її магії ніхто з дитинства не вчив і здібностей у неї немає. Акко прийшла в академію, натхненна чарівним спектаклем, який вона побачила в дитинстві. Сподіваючись на цікаві і веселі заняття, вона надходить в Академію Молодика, але більшість її занять - це всього лише теорія: читання книг, лекції, записи і майже ніяких практичних занять, що явно не до вподоби починаючій відьмі. Одного разу її клас відправляється в лабіринт для пошуку рідкісних предметів за вказівкою вчителя. Прогулюючись коридорами підземелля, Акко чує крик і, звичайно ж, тут же кидається на допомогу. Через деякий час, завдяки своєму другові-алхіміку, вона знаходить новий, ще незвіданий ділянку лабіринту. Монстрів? Стародавні артефакти? Чарівні загадки? Все потрібно знайти, дізнатися і побачити, не можна стояти на місці, адже це шанс показати себе і нарешті досягти успіху в чаклунстві. Примітка: «Академія відьом» є однією з чотирьох аніме-робіт, які отримали 38 мільйонів ієн (близько 480 000 доларів) від проекту підготовки молодих аніматорів 2012 року.