Пройшли тисячі років з тих пір, як все людство миттєво скам'яніло від цього загадкового явища. Коли Сенку Ісігамі, геній з надлюдським розумом, прокинувся і знайшов лише жалюгідні скам'янілі останки розвиненої цивілізації. Захоплений зненацька, але не зневірений, Сенку вирішує повернути старий світ силою науки. Згодом до нього приєднуються нові друзі і разом вони створюють Королівство Науки. Вогонь, залізо, електрика, скло, мобільний телефон... Людству знадобилося більше двох мільйонів років, щоб розвинутися від кам'яного віку до сучасної цивілізації, але Ісігамі і його друзі пройшли ці етапи набагато швидше завдяки знанням, навичкам і старанності, які вони вже мали. Однак не все так гладко, як хотілося б. У минулому найсильніший учень середньої школи, Цукаса Шісіо очолює Імперію Влади проти Королівства Науки. Мета Цукаси — очистити людство, і він зробить усе можливе, щоб зупинити розвиток науки за допомогою потужної військової сили. Що протистоятиме вундеркінду Санку своєму супернику?
Кам'яна війна розпочалася!