Сіндзіро Хаята не тільки має особливі здібності від природи, він також син Сіна, людини, яка стала першим Ультраменом в історії. Але Сіндзіро дізнається про це тільки тоді, коли на нього нападають невідомі вороги. Від лиходіїв Шінджіро рятує Ультрамен, а потім знімає маску, щоб показати, що він насправді його батько. У Сіндзіро немає вибору - він надягає костюм, пошитий колишнім членом SNPO (Спеціальної науково-пошукової партії) містером Іде, і вирішує допомогти батькові. З цього моменту починається справжня битва.