В один прекрасний день старшокласник знаходить чийсь особистий щоденник, який називається «Щоденник хвороби». Незабаром з'ясовується, що щоденник належить Сакурі Ямауті, однокласниці головного героя. Прочитавши її, Харукі Шига дізнається, що дівчина страждає від смертельної хвороби - у неї перестала працювати підшлункова залоза. Щоб підтримати її в цій непростій ситуації, юнак вирішує подружитися з Сакурою, незважаючи на їх абсолютно різні характери.