Юта Такемото - студент другого курсу художнього коледжу, який ділить дешеву квартиру з двома старшокурсниками - ексцентричним Шінобу Моріта, який не може закінчити навчання через прогули, та розумним Такумі Маямо, який ставиться до Такемото, як до справжнього старшого товариша, часто піклуючись про нього. Такемото мало думав про своє майбутнє, поки одного прекрасного весняного дня не зустрів чарівну Хаґумі Ханамото і не закохався з першого погляду. Хаґумі, надзвичайно обдарована в мистецтві, вступає до університету Такемото і незабаром стає подругою популярної студентки кераміки Аюмі Ямади. Аюмі вже добре знайома з трьома співмешканцями і таємно ховає глибокі почуття до одного з них. «Мед і конюшина» - це тепла історія юності, любові, пошуку власної душі та самопізнання, у якій переплітаються складні взаємини між п'ятьма близькими друзями.