Якби було проведено опитування, чи вірять люди в інопланетян, мандрівників у часі чи, можливо, есперів, більшість відповіла б, що ні; пересічний старшокласник Кьон вважає себе серед тих, хто не вірить. Однак у перший же день навчання він знайомиться з дівчиною, яка незабаром перевертає його світ з ніг на голову. Під час знайомства з класом красуня Судзумія Харухі сміливо заявляє, що їй набридло спілкування з "нормальними" людьми, і вона має намір зустрітися з надприродними істотами. Ошелешений Кьон дізнається про її фрустрацію через відсутність у школі клубів, присвячених паранормальним явищам, і мимоволі надихає її заснувати власний клуб. Вона створює "_Бригаду Судзумії Харухі, що поширює веселощі по всьому світу_", також відому як "**Бригада SOS**". Після заснування "Бригади SOS" Харухі вдається завербувати до неї Кьона та ще трьох членів: мовчазну книголюбку Наґато Юкі, боязку старшокласницю Асахіну Мікуру та вічно позитивного Коїдзумі Іцукі. Незважаючи на звичайну зовнішність, нові члени "Бригади SOS" зберігають власні таємниці, пов'язані з Харухі. Захоплений таємницею, що оточує ексцентричну лідерку клубу, Кьон потрапляє в низку пригод разом із Харухі та "Бригадою SOS", кожна з яких наближає його до правди про те, хто і що вона є.