Люди Ікс - це команда надпотужних мутантів, які були зібрані професором Чарльзом Ксав'єром для захисту простих смертних. Однак суспільство не визнає «вундеркіндів», і студенти професора змушені рятувати тих, хто готовий перегризти горло.
Після смерті одного з її членів колектив припиняє свою діяльність. Через рік професор отримує звістку про загадкове зникнення дівчини-мутанта в Японії. Підозрюючи, що за цим стоїть щось більше, Ксав'єр знову збирає команду і доручає їй розслідування.
Побоювання професора підтвердилися: герої дуже скоро виявляють зв'язок між зникненням дівчини і групою людей, які називають себе Людьми Ю.