Що відбувається, коли двоє людей люблять один одного, але їм не судилося бути разом? Такакі Тоно був близький з Акарі Сінохара з дитинства, але в середній школі через переїзд сім'ї Акарі в інше місто діти змушені припинити проводити час разом і скоротити спілкування до телефонних розмов і листування, обіцяючи підтримувати зв'язок і надалі. Однак час і життя окремо проклали відстань між їхніми серцями набагато більшу, ніж територіальна...
«П'ять сантиметрів в секунду» - романтична драма, яка зосереджена на буденній і суворій реальності відносин на відстані. Застрягли в минулому, не в силах заповнити порожнечу дитячих спогадів новими, Такакі і Акарі залишається тільки чіплятися за надію зустрітися знову, затягуючи похмурі будні, завдаючи шкоди собі і оточуючим людям в очікуванні цього дня.