Мікото Місака, один із найсильніших есперів 5-го рівня в Академія-Сіті, дізнається жахливу правду. Отримана від неї в дитинстві ДНК була використана для створення величезної кількості клонів. Вони були виведені з однією метою - створити найсильнішого в світі еспера 6 рівня. В результаті цього експерименту було принесено в жертву безліч примірників, до кожної з яких Мікото ставилася як до рідної сестри.
З якими випробуваннями зіткнулися Мікото та її подруга Куроко? Дізнаємося у другому сезоні серіалу «Рейлган».