Дія серіалу розгортається через два місяці після того, що сталося на підводному човні Tuatha Dé Danann наприкінці першого сезону. Мітріл дізнається про таємну організацію, яка володіє технологіями, здатними зламати ECS (Electronic Lock System). Ця організація, відома як «Амальгама», також володіє якоюсь «темною технологією», що походить від «візавра» на кшталт Канаме Чідорі (千鳥かなめ), і, як і інші спецслужби, не хоче зупинятися на досягнутому... Коли Мітріл відкликає місію Сосуке із захисту Чідорі, все необхідне для плану Амальгами приведено в дію...