Дія відбувається в недалекому майбутньому, де на Землю нападають прибульці з іншого виміру, так званої Нови. Історія розповідає про пригоди японського хлопчика на ім'я Аой Казуя (アオイ カズヤ), який вступив до спеціальної школи, призначеної для Пандори, генетично модифікованих дівчаток, єдиних, здатних на рівних боротися з інопланетянами, та їхніх партнерів - Обмежувачів, які мають здатність під назвою «Заморозити», що дозволяє Пандорі атакувати ворога. У школі Казуя знайомиться з незвичайною дівчинкою на ім'я Сателліза ель Бріджит (サテライザー エル ブリジット), яка виявляється найсильнішою Пандорою у своєму класі. Вона все ще не вибрала партнера, і, незважаючи на попередження друзів про Сателіта, який страждає від гаптофобії (страху бути доторканим іншими), Казуя вирішує стати її Обмежувачем.